Protein–RNA interactions for Protein: P25067

COL8A2, Collagen alpha-2(VIII) chain, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL8A2P25067 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 AL139099.2-201ENST00000555043 2469 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
COL8A2P25067 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
COL8A2P25067 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
COL8A2P25067 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms