Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 HMGN3-203ENST00000620514 1010 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
ITGA6P23229 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms