Protein–RNA interactions for Protein: P22362

CCL1, C-C motif chemokine 1, humanhuman

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL1P22362 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CCL1P22362 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CCL1P22362 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms