Protein–RNA interactions for Protein: P20851

C4BPB, C4b-binding protein beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BPBP20851 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CRYBG1-204ENST00000633556 9909 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 FADS1-201ENST00000350997 4525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 AFF3-202ENST00000409236 9849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SUCO-204ENST00000608151 5790 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 TRPM1-203ENST00000542188 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
C4BPBP20851 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.4 ms