Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPGDP15428 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPGDP15428 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPGDP15428 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPGDP15428 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPGDP15428 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPGDP15428 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPGDP15428 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPGDP15428 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPGDP15428 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
HPGDP15428 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
HPGDP15428 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 PPP2R2B-203ENST00000394411 2071 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
HPGDP15428 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
HPGDP15428 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms