Protein–RNA interactions for Protein: P13747

HLA-E, HLA class I histocompatibility antigen, alpha chain E, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-EP13747 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SRP19-202ENST00000445150 833 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
HLA-EP13747 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms