Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
U2AF1L5P0DN76 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms