Protein–RNA interactions for Protein: P0C0L5

C4B, Complement C4-B, humanhuman

Predictions only

Length 1,744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4BP0C0L5 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4BP0C0L5 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
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