Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
HOXB7P09629 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.4 ms