Protein–RNA interactions for Protein: P09603

CSF1, Macrophage colony-stimulating factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF1P09603 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
CSF1P09603 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 RBM17P1-201ENST00000453646 1190 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CSF1P09603 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms