Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
NGFRP08138 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NGFRP08138 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
NGFRP08138 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
NGFRP08138 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
NGFRP08138 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
NGFRP08138 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms