Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC087741.1-203ENST00000576824 820 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
POLR1AO95602 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CKLF-203ENST00000351137 508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 MROH1-202ENST00000423230 1712 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
POLR1AO95602 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms