Protein–RNA interactions for Protein: O43921

EFNA2, Ephrin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA2O43921 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
EFNA2O43921 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms