Protein–RNA interactions for Protein: O15550

KDM6A, Lysine-specific demethylase 6A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6AO15550 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
KDM6AO15550 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC005020.2-201ENST00000455905 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
KDM6AO15550 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34 ms