Protein–RNA interactions for Protein: J3QR89

Uncharacterized protein (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3QR89 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3QR89 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3QR89 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3QR89 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3QR89 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
J3QR89 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
J3QR89 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 ANKMY1-207ENST00000403283 2874 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 GFAP-214ENST00000588735 6538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
J3QR89 CEP85L-203ENST00000368491 7673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 AC016582.3-202ENST00000443870 6580 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 TBCE-202ENST00000406207 2012 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 SPTBN2-209ENST00000533211 8128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 CAND2-201ENST00000295989 4429 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 ITGAM-202ENST00000544665 4718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 PCK2-203ENST00000545054 2505 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 AL357143.1-202ENST00000640531 5777 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 SLC4A5-206ENST00000423644 6185 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 ROBO1-213ENST00000618846 7483 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
J3QR89 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3QR89 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3QR89 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3QR89 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3QR89 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3QR89 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3QR89 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3QR89 OCRL-202ENST00000371113 5162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3QR89 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3QR89 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3QR89 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
J3QR89 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms