Protein–RNA interactions for Protein: A6NKL6

TMEM200C, Transmembrane protein 200C, humanhuman

Predictions only

Length 621 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200CA6NKL6 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
TMEM200CA6NKL6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms