Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R1

SLC4A4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC4A4Q9Y6R1 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
SLC4A4Q9Y6R1 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms