Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5R8

TRAPPC1, Trafficking protein particle complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC1Q9Y5R8 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMKK2-201ENST00000324774 5598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ZHX1-201ENST00000297857 5200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CYP4F11-203ENST00000402119 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PLAGL1-206ENST00000416623 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 TNFRSF14-AS1-202ENST00000432521 3608 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TRAPPC1Q9Y5R8 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms