Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3Y2

CHTOP, Chromatin target of PRMT1 protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTOPQ9Y3Y2 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC007920.1-201ENST00000356133 2674 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TMUB2-201ENST00000319511 2418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ANKZF1-202ENST00000409849 2155 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC073869.1-201ENST00000415574 2762 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC12.83□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.35
CHTOPQ9Y3Y2 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
CHTOPQ9Y3Y2 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms