Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL40

ZNF346, Zinc finger protein 346, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF346Q9UL40 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
ZNF346Q9UL40 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
ZNF346Q9UL40 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.2 ms