Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL12

SARDH, Sarcosine dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 918 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SARDHQ9UL12 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SARDHQ9UL12 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SARDHQ9UL12 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms