Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKD2

MRTO4, mRNA turnover protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRTO4Q9UKD2 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
MRTO4Q9UKD2 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms