Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJU5

FOXD3, Forkhead box protein D3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3Q9UJU5 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
FOXD3Q9UJU5 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ATP5L2-201ENST00000505920 799 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
FOXD3Q9UJU5 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms