Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF6

RNF7, RING-box protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF7Q9UBF6 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
RNF7Q9UBF6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RNF7Q9UBF6 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms