Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBF2

COPG2, Coatomer subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPG2Q9UBF2 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
COPG2Q9UBF2 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
COPG2Q9UBF2 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms