Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYD6

HOXC10, Homeobox protein Hox-C10, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10Q9NYD6 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
HOXC10Q9NYD6 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SMN1-201ENST00000351205 900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SMN2-201ENST00000380741 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
HOXC10Q9NYD6 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms