Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW7

VPS45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS45Q9NRW7 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SEC23A-206ENST00000553970 574 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
VPS45Q9NRW7 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
VPS45Q9NRW7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms