Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRE1

MMP26, Matrix metalloproteinase-26, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MMP26Q9NRE1 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 BAIAP2-203ENST00000416299 1442 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
MMP26Q9NRE1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
MMP26Q9NRE1 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms