Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZN0

GPR88, Probable G-protein coupled receptor 88, humanhuman

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR88Q9GZN0 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC19.26■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
GPR88Q9GZN0 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms