Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SMIM3Q9BZL3 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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