Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXA9

SALL3, Sal-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SALL3Q9BXA9 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 LRIG1-201ENST00000273261 5273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SALL3Q9BXA9 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms