Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH5

HDHD3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDHD3Q9BSH5 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 DIABLO-204ENST00000413918 1859 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
HDHD3Q9BSH5 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.07■□□□□ 0
HDHD3Q9BSH5 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms