Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ08

RETNLB, Resistin-like beta, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RETNLBQ9BQ08 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 INO80-201ENST00000361937 6439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ITSN1-212ENST00000399367 5722 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PRLHR-201ENST00000239032 5446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RALGAPA1-201ENST00000307138 7911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 COBL-203ENST00000395542 5339 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NHLH2-202ENST00000369506 7226 ntAPPRIS P1 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
RETNLBQ9BQ08 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms