Protein–RNA interactions for Protein: Q99590

SCAF11, Protein SCAF11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAF11Q99590 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SCAF11Q99590 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAF11Q99590 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAF11Q99590 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SCAF11Q99590 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms