Protein–RNA interactions for Protein: Q99417

MYCBP, c-Myc-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCBPQ99417 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 LRRTM1-201ENST00000295057 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 UBE3A-227ENST00000638011 8742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 LINC00887-202ENST00000414120 2880 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 PEX5-207ENST00000455147 2689 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
MYCBPQ99417 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms