Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CCDC7Q96M83 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CCDC7Q96M83 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms