Protein–RNA interactions for Protein: Q96M20

CNBD2, Cyclic nucleotide-binding domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNBD2Q96M20 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 OGFRL1-201ENST00000370435 8391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CNBD2Q96M20 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms