Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC004790.2-201ENST00000623588 572 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC27.36■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AC254562.1-201ENST00000417586 456 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
LRRIQ1Q96JM4 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms