Protein–RNA interactions for Protein: Q96J65

ABCC12, Multidrug resistance-associated protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC12Q96J65 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ZNF789-202ENST00000379724 510 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ABCC12Q96J65 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.1 ms