Protein–RNA interactions for Protein: Q96IT1

ZNF496, Zinc finger protein 496, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF496Q96IT1 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 REXO1L9P-201ENST00000604264 2108 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 PPP2R5A-201ENST00000261461 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ZNF496Q96IT1 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms