Protein–RNA interactions for Protein: Q96DZ9

CMTM5, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM5Q96DZ9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
CMTM5Q96DZ9 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms