Protein–RNA interactions for Protein: Q96CC6

RHBDF1, Inactive rhomboid protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF1Q96CC6 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RHBDF1Q96CC6 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms