Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVE6

TMEM171, Transmembrane protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM171Q8WVE6 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM171Q8WVE6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 PRELID3A-209ENST00000592149 2001 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 FZD10-201ENST00000229030 3281 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
TMEM171Q8WVE6 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms