Protein–RNA interactions for Protein: Q8NE01

CNNM3, Metal transporter CNNM3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNNM3Q8NE01 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
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CNNM3Q8NE01 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
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CNNM3Q8NE01 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CNNM3Q8NE01 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
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