Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCL9

APCDD1L, Protein APCDD1-like, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APCDD1LQ8NCL9 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 ATP6V0C-202ENST00000564973 1081 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
APCDD1LQ8NCL9 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 ZNF554-204ENST00000591265 1148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 RAVER1-207ENST00000615032 1952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 LETM1P2-201ENST00000597330 2178 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
APCDD1LQ8NCL9 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms