Protein–RNA interactions for Protein: Q8N5G0

SMIM20, Small integral membrane protein 20, humanhuman

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Length 67 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM20Q8N5G0 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ANKRD11-201ENST00000301030 9301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ARMCX2-201ENST00000328766 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PADI2-202ENST00000375486 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 EFR3B-205ENST00000405108 2432 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PABPC1-201ENST00000318607 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MVP-202ENST00000395353 2925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PPME1-201ENST00000328257 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NRXN1-259ENST00000637511 3651 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ROPN1-206ENST00000479867 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MGRN1-203ENST00000415496 6405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 HOXA-AS2-202ENST00000517635 2455 ntTSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NSD2-203ENST00000382888 2666 ntTSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.1□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 STAB1-201ENST00000321725 7928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
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SMIM20Q8N5G0 CASR-202ENST00000498619 5009 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MEGF8-201ENST00000251268 9549 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SULT1C4-201ENST00000272452 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TGIF2-201ENST00000373872 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 SMTN-203ENST00000358743 3198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC11.09□□□□□ -0.63
SMIM20Q8N5G0 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.09□□□□□ -0.63
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