Protein–RNA interactions for Protein: Q8N3C7

CLIP4, CAP-Gly domain-containing linker protein 4, humanhuman

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Length 705 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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CLIP4Q8N3C7 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CLIP4Q8N3C7 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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CLIP4Q8N3C7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MIEF2-204ENST00000395706 2441 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CLIP4Q8N3C7 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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