Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVL6

P3H3, Prolyl 3-hydroxylase 3, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P3H3Q8IVL6 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
P3H3Q8IVL6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 HTATSF1-204ENST00000535601 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC021188.1-201ENST00000421534 740 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC018558.2-201ENST00000566562 480 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
P3H3Q8IVL6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms