Protein–RNA interactions for Protein: Q76NI1

KNDC1, Protein very KIND, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KNDC1Q76NI1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 PRODH-205ENST00000420436 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 ZZZ3-201ENST00000370798 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
KNDC1Q76NI1 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms