Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXH8

CCBE1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1Q6UXH8 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CCBE1Q6UXH8 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AL365295.1-202ENST00000456100 562 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCBE1Q6UXH8 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.7 ms